多米尼加原来由阿拉瓦克人（Arawak语系）的一支——台诺族（Taíno）和其他加勒比人（Carib）居住，他们称自己居住的岛屿为Kiskeya或是Quisqueya，为“大地的母亲”的意思，也有原住民称之为Haití（海地） 或是Aytí，Bohio。台诺族当时主要以农耕，守猎，鱼获和采集食物为主。1492年时粗计台诺族人口数字从10万人到200万人都有。当时共分为五个酋长国：Marién、Maguá、Maguana、Jaragua、Higüey。这些酋长国之下又分成小酋长国。这些酋长国以一种进贡制度为基础，进贡的物品包括了台诺族所耕种的食物。

[编辑] 西班牙统治1492-1795
主条目：1492年
哥伦布首航舰队带领着九十多位船员抵达西班牙岛的北边海地附近。台诺族人以为这些欧洲人是超自然的生物，于是竭尽所能地招待这些欧洲人。两者的社会完全不同，欧洲人穿着的衣服数量激起了当地原住民的好奇心，因此开始称这些欧洲人为“guamikena”——“盖住的人”。Marién的酋长瓜卡纳加里克斯（Guacanagarix）热情地招待了哥伦布及他的队员，提供了他们所需的物品。此后西班牙人开始以这里当作跳板逐渐征服了加勒比海列岛和美洲大陆。

哥伦布于1492年12月5日登陆于岛上西北端，为现今为海地的圣尼可拉镇附近，哥伦布宣布整个岛归属于西班牙，并取名为西班牙岛。12月23日哥伦布的航船搁浅于今日的海地角附近，不得以他只好留置舰上其中39人于陆地，用沉船的枕木在当地建立了"圣诞节堡垒"。哥伦布随着剩下的舰队继续往东北航行，探查今日多米尼加北部海岸，随后即折返西班牙。隔年11月哥伦布带领着十一艘航舰返回圣诞节堡，发现堡内的西班牙人因为强虏台诺人妇女而全部遭到当地土著杀害。哥伦布后来在圣诞节堡东边建立了伊莎贝拉堡，以纪念当时的西班牙伊莎贝拉皇后，伊莎贝拉城为美洲第一个殖民地，西班牙人以此为根据地开始往岛内探索，并逐渐在北部内陆现今的圣地牙哥附近建立了其他根据地。伊莎贝拉城五年后由于当地传染病肆虐，最后只得迁都到西班牙岛南方现今的圣多明各城。哥伦布于西元1506年去世，葬于现今圣多明各城附近。

主条目：圣多明各城
西元1496年哥伦布的弟弟巴尔托洛梅奥·哥伦布在岛上的南边，现今的圣多明各建立了"新伊莎贝拉城"，新伊莎贝拉城视为欧洲人在新大陆所建立的第一个永久殖民地。16世纪中叶开始，西班牙人在岛上开始大量种植农作物，西班牙岛逐渐的成为欧洲人前往征服加勒比海岛屿和安第列斯群岛的跳板，最后进入了美洲大陆。

西班牙人登陆西班牙岛上后，逐渐开始对台诺族人施行奴隶统治，许多原住民因为反抗而遭到杀害，也有少许人逃往古巴，另外也有些人反抗中获得胜利，得到些许喘息的机会。台诺族人本身缺乏抵挡西班牙人带来的传染病的免疫力，加上西班牙人施予的各种迫害虐待，台诺人被虐待死亡和自杀的人数不断，据统计从哥伦布到达西班牙岛上后短短30年间，塔诺族人口从40万人骤减不到三千人。西元1864年曾有西班牙军人描述台诺族人于复国革命时曾抵抗西班牙军队的占领，此后就无任何有关台诺族的记载，目前认定该族人已完全灭绝。台诺族人的壁画遗址目前仍可在当地的国家公园内多处的洞穴中观察到。由于岛上需要大量耕种人力，西班牙人于1520年开始引进非洲奴隶进行耕种，1568年时引进到岛上的非洲奴隶已多达两万人，19世纪初时岛上的黑奴已达到50万名。